人體裏的動物園與佔據身體90%微生物共存

我把書看完了才發現這是一位女性作者。 作者很有勇氣，她在一次熱帶雨林做研究時，被蜱蟲感染，爲了治療，她接受了很長的抗生素療程，使得她身上很多益生菌被破壞，身體開始出現不良過敏反應。 爲了搞清楚自己的身體到底發生了什麼，作者開始進行微生物相關的研究，才誕生了我們閱讀的這本書籍。 先對作者的勇敢與毅力說一聲respect！ 接下來我要開噴了，這本書有兩個特別大的缺點： 一，作者完全是爲了證明自己的觀點，而大量引用一些對自己有利的研究，而且很多研究的數據和實驗本身還非常有爭議性（更搞笑的是，作者一開始巴拉巴拉說了十幾頁後，才說“但是這個研究還飽受爭議”。玩我呢？） 二，作者太羅嗦了。本來400頁能寫完的書，非要寫700頁。書中時不時就要出現一段之前早就出現過的重複內容。最後有一章【總結】，把此前提到過的所有內容又重複一遍。 據以此，一方面我相信作者寫這本書是因爲她要搞懂關於微生物的知識，另一方面，我又懷疑，作者也想順便賺一波書稿（國外的書籍出版難道也按字數收費？）。 你說她要搞懂微生物吧，怎麼書中也不提一提關於微生物生物學上的分類，或者微生物的一些普遍知識，通篇都是微生物的治療有多麼多麼好，我們對微生物治療不夠重視。我差點都要以爲下一章就要放產品鏈接了。 因此，大家千萬要警惕這種僞科普類書籍。也不要把這本書當作科普書來看。 你要當作故事書，或者知乎小文章來看，這本書就還是有不少可圈可點的地方。確實她提到過的很多病例和知識點很有意思，也很有啓發性，比如最後那個糞便移植治療。 有一些觀點，我在尹燁老師那裏聽到過，比如我們人體的大部分其實是微生物，人的很多身體特徵會通過微生物來顯現，人的遺傳不單單是DNA遺傳，還有微生物的傳遞......我差點懷疑作者是不是尹燁的小號。。 當然，我也差點犯了傲慢的錯誤。比如關於自然生產比剖腹產更好的觀點，我帶了點情緒，因爲我認爲女性有權利選擇減少自己的痛苦。我差點爲此棄書。還好，我當時向GPT求證了一下，發現作者的觀點還真是對的。 但是關於自閉症，作者就很誇大其詞了。目前關於精神疾病，普遍還是認爲遺傳因素較大，而不是什麼微生物導致。 希望作者再寫下一本書時能正視這些問題。 看在書的內容還算有啓發性，依舊給個【推薦】吧，但是我建議大家還是跳着來看。我相信某硅谷大佬納瓦爾同志會認同我的觀點。

你知道身體肥胖可能是因爲被病毒感染了嗎？你知道身邊爲什麼擁有“文明病”的人越來越多嗎？你知道身體中還存在着“第二個大腦”嗎？這是非常非常有意思的一本書！作者的文筆特別詼諧有趣，各種有關微生物的故事娓娓道來，印象最深刻的故事就是有關泡泡男孩（一個從小在無菌環境中長大的男孩）以及孤獨症的病因可能是由於微生物多樣性的缺乏或者區系的改變。 另外之前只知道抗生素一直被濫用，但沒有太過在意這個事，而且以爲抗生素的作用就是減少動物染病的概率，沒想到是雞喫了抗生素之後可以快速增肥，是不是雞的微生物區系也被破壞了，所以導致雞一下子變胖了呢？如果雞喫了抗生素會變胖，人會不會也一樣呢？而且很多人生病喫激素的藥之後體重就減不下來了，可能就是內循環被破壞了。平常真的要多喫蔬菜好好保護腸道的微生物。沒事不要喫抗生素，畢竟抗生素也治不了病毒感染。 另外關於母親方面學到的就是母乳真的很重要啊啊啊，生命真的是一種很神奇的存在，在餵母乳的時候會把有益菌傳給寶寶，同時哺乳對媽媽也是有好處的，會減少在晚年患糖尿病、高血壓和心臟病的風險。還有剖宮產的風險其實高於自然分娩，容易造成感染、大出血以及麻醉產生的問題。感覺自己小的時候經常生病就是因爲一直喝奶粉，導致沒有建立足夠的微生物菌羣，長大以後才慢慢不生病了。 最後就是中醫的“黃湯”原來是有科學依據的，古人的智慧真是博大精深，有太多太多的東西目前的科學都解釋不出來，我們對這個世界瞭解得還是太少了。

乙巳年冬月十七《人體裏的動物園：與佔據身體90%微生物共存》已讀完，大概用時2小時。這本書也是一本科普讀物。 有些話想分享給大家，如果覺得打擾，可以忽略，謝謝。 說起來這本書是受上一本書《迷人的液體》影響開始閱讀的，關鍵詞就是書的名字中提到的人體、微生物。 人體是由細胞構成，細胞分裂，生長，分化，使各位從一個受精卵變成了擁有心肝脾肺腎，大腦等器官，組織的複雜生命體。 這本書認爲你的身體不單單屬於你自己，而是一個由人類細胞和數萬億微生物共同組成的、複雜而活躍的超級生命體。 這些微生物（主要是細菌，也有病毒、真菌和古菌）主要居住在腸道、皮膚、口腔、呼吸道等部位，它們共同構成了你的“微生物組”。 比如我們的腸道，口腔，生殖道中，都存在成千上萬中不同的微生物菌羣，例如爲什麼有的人一喫奶製品就拉肚子，或者放屁，這有可能是乳糖不耐症，那個人可能缺少乳糖酶，也可能缺少某種菌羣。 這本書還提到了微生物和各種疾病，身體狀態有什麼關係，例如它提到肥胖可能是感染了某種病毒；微生物也會影響人的免疫系統，產生過敏，哮喘等等疾病；通過研究發現微生物甚至可以通過不同的途徑與大腦交流，進而影響情緒等。 到這，可能覺得淡淡的，作者舉了一個大多數人都能理解的案例。書中提到自然分娩和剖宮產分娩，認爲順產使嬰兒首先接觸母親產道和腸道內的菌羣，剖腹產使嬰兒首先接觸到環境中的菌羣，影響早期免疫系統發育。書中還提到了母乳中含有某種有益的菌羣，配方奶則略顯遜色，因此奶粉餵養的寶寶抵抗力差；糞便移植，濫用抗生素擔憂等。 讀完這本書收穫了很多有意思的科普知識，我也再一次感慨認知角度不同，形成了不同的世界觀。 書中提到一個患有某種疾病的可憐小男孩直到12歲死亡前，一直生活在無菌環境，醫生費盡心思幫他延續生命，不幸的是他姐姐骨髓中帶有某種病毒，移植後被感染，死亡。書中也提到早年間西方外科醫生沒有清潔消毒的習慣，反而以白大褂越髒身體散發的味道越濃烈爲榮，以此彰顯自己的專業程度。有的醫生甚至剛上了解剖課經過停屍房沒有洗手消毒就給產婦接生，後果當然是莫名升高的產婦死亡率。有個醫生大膽猜想假設其中的緣由，並通過實際行動驗證，終於降低了死亡率，但這一行爲在當時被認爲是離經叛道的，那個醫生最後也在精神病院去世。 由此可見傳統西醫學強調消毒殺菌，對這些微生物視作敵人，正如本書書名，人的身體中百分之九十是微生物，人體與這些微生物友好共同相處，進一步促進人的生長發育，而不是一棒子打死，都是壞東西，要消滅。 書中有一個章節講到人如其食，微生物喫什麼，你就變成什麼，這裏與古老的東方智慧不謀而合。中醫講究天人合一，脾胃爲後天之本，脾胃主運化，是氣血生化之源，用西醫無限微觀視角觀察一下，這不就具體到了那些腸道菌羣的作用嗎？ 這本書讀完後並沒有太深刻的讀後感，只是久久沉浸在驚訝中，那個心理學工作者車禍後感染了一種細菌，最後不得不截肢，但仍沒有挽救自己的生命，最後惡化。人還是很渺小的，對自然，仍需要保持敬畏之心。

青春期性行爲之所以容易受到腸道微生物影響，可從以下幾條生物學鏈條來理解： 1. ​​激素水平驟變，爲微生物-宿主互作提供“信號”​​ • 青春期伴隨顯著的性激素（雌激素、睾酮等）升高，這些激素不僅驅動第二性徵發育，也會直接調節腸道黏膜屏障、消化酶分泌及免疫細胞功能，從而改變腸道環境。微生物羣落對這種激素信號極爲敏感，可在數週內調整代謝途徑與菌羣組成。 2. ​​腸道-大腦-免疫軸的化學通信在青春期被“放大”​​ • 腸道微生物通過代謝物（短鏈脂肪酸、色氨酸衍生物等）與中樞神經和免疫系統對話。青春期大腦突觸重塑和情緒波動劇烈，任何來自腸道的化學信號都會被放大，進而影響性衝動、風險判斷和社交動機。例如，孤獨症相關菌羣產生的代謝物可破壞腸壁並進入大腦，引發行爲與情緒異常。 3. ​​免疫系統仍在“打磨”階段，性行爲帶來的抗原刺激與微生物互作更明顯​​ • 性行爲會將外界微生物帶入新的生態位，加之青春期免疫系統尚未完全成熟，對這些外來抗原的反應更劇烈。腸道微生物可迅速調整免疫活化狀態，以適應性行爲帶來的挑戰，這種“即時訓練”在青春期尤爲突出。 4. ​​性行爲本身會直接改變腸道微生物組​​ • 研究發現，與男性發生性行爲（MSW）與男男性接觸者（MSM）相比，後者擁有明顯不同的腸道微生物組，且這種差異與T細胞活化及HIV易感性相關。說明性行爲模式本身就是選擇壓力，可迅速塑造腸道生態，反過來再影響激素、免疫與行爲。 5. ​​生活方式與飲食習慣在青春期高度變動，進一步擾動微生物​​ • 性活動增加往往伴隨飲食結構、作息、壓力水平的變化，這些都會通過“營養競爭”“黏膜刺激”等機制改變腸道菌羣多樣性，從而間接影響性激素與情緒。 綜上，青春期性行爲與腸道微生物形成了一條“激素-微生物-免疫-行爲”閉環： • 激素飆升→改變腸道環境→微生物羣落快速重組→代謝物與免疫信號變化→影響大腦及性行爲； • 性行爲本身又把新微生物帶入體系，進一步微調這一閉環。因此，青春期成爲腸道微生物與宿主共同塑造性行爲的關鍵窗口期。

阿蘭娜·科倫在2015年寫作時，微生物組研究正處於從"相關性觀察"邁向"機制與干預"的轉折點。十年來，書中提出的多數核心觀點不僅被進一步證實，部分還經歷了重要修正，並從"有趣的科學假說"走到了"臨牀指南"。下面按書中核心命題逐條對照最新進展。 一、"10% 人類"的修辭被修正，但"超有機體"框架更穩了 書中最具傳播力的數據——"你只有10%是人類"——在2016年就已被重新估算推翻。 以色列魏茨曼研究所 Sender、Fuchs 和 Milo 在 PLOS Biology 發表的修正論文逐項重算後給出新數字：標準70公斤男性體內約有30萬億個人類細胞、38萬億個細菌，比例接近 1:1，而非 10:1；細菌總質量約0.2公斤。科普中國的科普文章也明確指出，"每次排便會讓腸道細菌減少三分之一"，所以"人是細菌多還是細胞多"在一天之內都會反覆切換。 但這個修正沒有動搖科倫的核心命題，反而讓它更精確：數量上雖接近1:1，微生物承載的基因數量卻是人類的百倍以上，是名副其實的"第二基因組"。"超有機體"這個框架比"10%"那個修辭更經得起時間考驗。 二、飲食→菌羣→健康：從"喫什麼養什麼菌"升級爲"微生物轉向" 這是進展最紮實的領域。2024年10月，比利時魯汶大學（正是科倫書中引用的卡尼教授所在機構）在 Nature Reviews Microbiology（IF:69.2）發表重磅綜述，系統闡述了膳食纖維與腸道微生物組的互作及其對肥胖、心臟代謝疾病和癌症的影響。 關鍵進展有三層： 1. 膳食纖維的發酵產物被鎖定爲短鏈脂肪酸（SCFAs） 可溶性纖維在結腸被共生菌發酵，主要產生乙酸、丙酸、丁酸。2025年 Foods 期刊綜述明確指出，SCFAs 通過 GPR41/GPR43 等受體促進 GLP-1 和 PYY 分泌、增強胰島素敏感性、抑制 TNF-α 和 IL-6 等炎症因子，對2型糖尿病有明確的改善機制。 2. 營養科學正在經歷"微生物轉向" 2025年11月 Nature Reviews Gastroenterology & Hepatology 的綜述提出：食物的營養效應往往要通過菌羣這一"中間層"實現——同一高纖維飲食，不同個體的血糖反應可能完全不同，因爲菌羣構成不同。這直接解釋了科倫書中"飲食是微生物的遙控器"的深層機制。 3. 纖維的"異質性"被重視 最新綜述強調：不是所有纖維都一樣。纖維的化學結構、溶解度、發酵能力差異巨大，對特定菌羣的影響不能一概而論；成年人每天應攝入25-30克纖維的全球達標率仍極低。這意味着科倫書中"高纖維有益"的方向是對的，但精細化、個體化是新一代研究的重點。 三、腸-腦軸：從"現象描述"走向"神經迴路級機制" 科倫在書中用比利時女孩A小姐的惠普爾病例來說明腸-腦軸，當時這還是個相對前衛的假說。十年後，這一領域爆發式進展： 機制層面，2024年 Cell 發表的研究揭示了慢性壓力→大腦杏仁中央核→迷走神經→十二指腸腺→乳桿菌→免疫的完整神經迴路。這是首次在神經迴路水平上證明"壓力通過腦-腸軸改變菌羣"的具體路徑。 疾病層面，Nature Medicine 2024年研究揭示了肝性腦病的腸-腦軸新機制：活潑瘤胃球菌通過苯丙氨酸脫羧酶產生苯乙胺驅動肝性腦病，靶向該通路可逆轉神經症狀。 綜述層面，Nature Reviews Microbiology（IF:103.3）系統總結了菌羣與大腦的四種交流途徑：菌羣衍生物穿越血腦屏障、激活免疫細胞分泌細胞因子、刺激腸內分泌細胞分泌激素、通過腸道感覺神經傳入中樞。 ⚠️ 需要冷靜看待的是：菌-腸-腦軸在帕金森、阿爾茨海默、抑鬱、自閉症等領域確實有大量FMT（糞菌移植）探索性治療，但除複發性艱難梭菌感染外，多數神經精神疾病的FMT治療仍處於臨牀探索階段，尚未形成一線推薦。中華結直腸疾病電子雜誌2025年綜述也明確指出，FMT治療帕金森病、AD等"取得良好成效"的研究多爲小樣本，需要更大規模RCT驗證。 四、糞菌移植（FMT）：從先鋒實驗到規範化臨牀手段 這是書中"微生物修復"章節落地最徹底的部分。 1. 複發性艱難梭菌感染：FMT已成首選 英國胃腸病學會（BSG）與英國感染學會（HIS）2025年聯合發佈的第二版指南，明確將FMT定位爲複發性/難治性艱難梭菌感染的首選治療手段，單次FMT治癒率達80%-90%，遠高於抗生素；嚴重不良事件發生率約0.1%。 2. 炎症性腸病：2025版中國專家共識出爐 中華醫學會腸外腸內營養學分會等牽頭制定的《腸菌移植治療炎症性腸病專家共識（2025版）》給出29條推薦意見，覆蓋適應證選擇、供體篩選與質控、移植途徑與劑量、併發症處理全流程。共識特別強調：FDA曾報告因供體耐藥菌轉移導致嚴重感染甚至死亡的案例，供體篩查合格率不足10%——這意味着FMT絕非"民間可以嘗試"的療法。 3. 跨適應證拓展 2025年《腸道菌羣移植治療免疫介導性皮膚病指南（2025版）》發佈，針對特應性皮炎、銀屑病、斑禿、紅斑狼瘡等免疫介導性皮膚病給出循證推薦。肥胖症領域也有《腸道微生態製劑及菌羣移植治療肥胖症專家共識（2025版）》，指出多菌株益生菌製劑療效可能優於單一菌株。 4. 技術精細化 新一代FMT不再是簡單的"糞便移植"： - 製備過程需用丙啶單氧化物結合qPCR區分活菌/死菌，確保活菌計數 - 嚴格厭氧條件保留普拉梭菌、脆弱擬桿菌等關鍵抗炎有益菌 - "糞便菌羣移植+小腸液移植"的全菌譜移植成爲新型方式 - 口服膠囊因安全便捷成爲主流給藥形式之一 五、書中未充分展開、但近五年爆發的新方向 除了驗證和修正，微生物組研究還出現了科倫2015年書中未能預見的新前沿： "腸-X軸"全面開花：除腸-腦軸外，腸-肝軸、腸-心軸、腸-皮軸、腸-關節軸、腸-肺軸等均發現菌羣參與。例如 Science 2024年研究首次發現"腸-關節軸"在骨關節炎中的作用：梭狀芽孢桿菌合成的GUDCA通過抑制FXR促進GLP-1分泌，緩解關節病變。 精準化與量化評估：倫敦國王學院等機構2025年發表於 Nature 的研究，整合3.4萬人羣的宏基因組、臨牀與飲食數據，構建了"腸道微生物組健康評分"體系，可穩定預測個體血糖、血脂、炎症水平及代謝疾病患病風險，並在全球超7800人中得到驗證——這意味着"測菌羣、評風險、定干預"的個性化時代正在到來。 代謝產物成爲新主角：研究熱點從"活菌本身"轉向短鏈脂肪酸、吲哚衍生物、次級膽汁酸、後生元等代謝產物。《腸道微生態製劑及菌羣移植治療肥胖症專家共識》（2025版）明確指出，益生菌可通過調節腸道菌羣失衡治療肥胖症，且多菌株益生菌製劑療效可能優於單一菌株製劑。 芳香烴受體（AHR）成爲免疫調節新靶點：Nature Reviews Drug Discovery 2024年綜述指出，首個FDA批准的AHR激活劑Tapinarof已用於治療銀屑病；腸道菌羣代謝產物本身就是AHR的內源性配體——這把"菌羣-免疫"的調控機制推進到了藥物開發層面。 六、需要保持謹慎的邊緣 客觀來看，書中部分觀點在新證據面前需要"降降溫"： - 益生菌的侷限被更清楚認知：市面上大多數益生菌菌株對健康人羣的獲益證據並不像書中暗示的那麼強；"選對菌株、持續補充"的原則是對的，但具體哪株對哪種病有效，需要嚴格RCT驗證，而非一概而論。 - 剖宮產與菌羣的因果關係：書中將剖宮產與兒童過敏、哮喘風險升高直接關聯，新研究更傾向於這是一個混雜了母體菌羣、環境、餵養方式等多因素的複雜問題，而非單向因果。 - "重塑菌羣就能治病"的樂觀預期：FMT對艱難梭菌感染幾乎根治，但對多數慢性病的療效仍在探索，菌羣干預不是萬能藥。

《我們只有10%是人類：認識主宰你健康與快樂的90%微生物》 阿蘭娜·科倫 56個筆記 ◆ 序曲 另外的90% >> [插圖] >> 瞭解我們身上的微生物，會帶來一種關於我們個體的新視角，一個我們與微生物世界的關聯的新認知。微生物是我們在幼年生活中與家人及環境相互作用的遺贈，它們讓我們停下來思考人類演化也許還有其他維度。 ◆ 第1章 21世紀文明病 >> 儘管存在差異，但這些不同的疾病有兩個特點。第一個特點是免疫系統，它將過敏與自身免疫性疾病畫了等號。我們的身體一直在尋找干擾免疫系統功能的罪魁禍首，導致經常出現過度反應。第二個特點，是隱藏在更多的常見症狀之後的腸道功能紊亂。一些現代疾病之間的關聯很明顯 >> 免疫系統和腸道這兩個特點，也許看起來並不相關，但仔細研究腸道結構可以提供進一步的線索。提到免疫系統，多數人會想到白細胞與淋巴結，但這並不是免疫系統最活躍的部分。事實上，人類腸道中的免疫細胞數量，比存在於身體其他部位的免疫細胞數量總和還多，大約60%的免疫系統組織位於腸道周圍，特別是在小腸末尾、進入盲腸及闌尾那一段。我們理所當然地將皮膚視爲人體的保護層，卻沒想過腸道也是。雖然腸道位於體內，但它僅有薄薄一層細胞將外來物質與血液隔開，因此腸道周圍的免疫系統變得更爲關鍵——經過此處的每個分子和細胞都會被評估，並且在必要時被隔離出來。 >> 通過對事件、對象、地點、時間的分析，我們能夠得出四點結論。第一，“21世紀文明病”通常由腸道開始，並且與免疫系統有關。第二，這些疾病通常發生在年輕人身上，通常是兒童、青少年及青壯年，並且很多疾病女性患者多於男性。第三，這些疾病多出現在西方世界，然而如今在逐漸現代化的發展中國家也越來越流行。第四，這些疾病的興起始於20世紀40年代的西方，並且發展中國家也隨後跟上。 ◆ 第2章 所有疾病都源於腸道 >> 卡尼懷疑是“肥胖的”微生物區系導致了發炎反應，並且改變了脂肪儲存的方式。他知道有些住在腸道內的細菌會被一種叫作“脂多糖”（lipopolysaccharide，簡稱LPS）的分子覆蓋，這種分子若是跑到血液中則會形成毒素。果然，他發現肥胖的人血液中有大量的脂多糖，而脂多糖就是造成脂肪細胞發炎的原因。更引人注目的是，卡尼發現脂多糖會阻止身體形成新的脂肪細胞，所以已經存在的脂肪細胞就會被繼續裝到滿溢。 >> 瘦人的腸道微生物羣系中大約有4%屬於這種細菌，但肥胖者的腸道內幾乎沒有這種細菌。這種細菌名字中的muciniphila意爲“喜歡黏液的”，它們生活在厚厚的黏液表層，而這些黏液會形成阻止微生物區系進入血液的屏障，因爲微生物進入血液後可能會變得有毒性。阿克曼氏菌的數量不只會影響身體質量指數，這種細菌的含量越低，黏液層也會越薄，血液中的脂多糖含量就會越高。 >> 讓肥胖小鼠喫高脂肪飲食，會降低其阿克曼氏菌的含量，但是如果在飲食中補充纖維，則可以讓細菌數量回到健康水平。 >> 手術的一週內，腸道里的微生物區系不再像肥胖者，而是開始與瘦人的微生物區系變得相似，擬桿菌和厚壁菌的比例會顛倒過來，阿克曼氏菌的數量也會增加大約1萬倍。 >> 包括病毒與細菌在內的微生物表明，肥胖症不完全是因爲喫得太多、活動太少，我們從食物中獲取的能量，以及能量以什麼樣的方式被人體運用及儲存，都與我們身上的微生物區繫有着複雜的關聯。 ◆ 第3章 精神控制：大腦與感覺也受腸道微生物控制？ >> 改變宿主的身體，是生物增加自身演化適應性（繁殖後代的機會）的一種方法。但其實還有另一種方法：改變宿主的行爲。 >> 這些微生物演化出控制行爲的能力，好讓自己擴散到新的宿主身上。感染狂犬病的狗將別的狗咬傷，病毒就能借此傳到其他狗身上，繼續繁殖；弓形蟲操縱老鼠接近貓，等老鼠被貓喫掉之後繼續它的生命週期；而金線蟲必須在有水的地方纔能找到伴侶並繁殖下一代。可控制宿主行爲的這項能力，讓微生物增加了生存及繁衍的機會，這也是演化對它們的恩惠。 >> 儘管大腦和腸子相距遙遠，功能也完全不同，卻擁有雙向的緊密聯繫：不只情緒會影響腸道運作，腸道的活動也會影響情緒和行爲。 >> 腸道里的微生物似乎能讓它們變得更友善。除了友誼，你身上的微生物區系甚至也有可能影響你對伴侶的選擇。 >> 也就是說，女性可以通過嗅覺審查男性的基因組，爲後代尋找最合適的父親。 >> 通過親吻，我們也在決定是否要信任眼前這個人，不論是情感上還是生物學上。 >> 這涉及迷走神經——從大腦延伸到腸道的主要神經，其中分出許多分支連接不同的器官。神經就像電線，通過傳遞微小的電脈衝來傳遞指令或改變感覺。迷走神經會將腸道運作的信息——正在消化什麼東西、活躍性等——傳到大腦，其特別之處在於它也會將“腸道的感覺”傳到大腦 >> 血清素、腎上腺素、多巴胺、催產素等物質大部分都是由我們的身體合成，它們會在神經末梢引發微小的電位刺激。但是神經遞質並不全由人類細胞製造，我們的微生物區系也參與其中，它們也會製造同樣功能的化學物質，刺激迷走神經並且與大腦溝通 >> 增加腸道有益菌對免疫系統有鎮定的效果，不僅可以防止色胺酸被破壞、使人更快樂，還可以減少發炎。 >> 當吞噬病原體的免疫細胞同時吞噬了多餘的突觸後，大腦出現炎症是正常的。學習就是記憶與遺忘之間的精確平衡，建立連接並發現模式是智慧的標誌，但這個過程若是進展太快則會使人生病 >> 。但人格特質能從一個人傳給另一個人，這個想法確實將我們的思路拓展得更寬了 ◆ 第4章 自私的微生物：過敏是因爲免疫系統太盡責？ >> 過敏是免疫系統過度反應的結果，它會摧毀那些對身體其實沒有威脅的物質。要治療過敏反應，通常會用類固醇或抗組胺藥物來鎮定免疫系統。 >> 毛茸茸的哺乳類直到左手中指的位置時纔出現，而人類歷史的長度就像中指指甲末端一根絨毛寬的距離。所以纔有此一說：只要用指甲銼輕輕一銼，我們存在的所有痕跡便會消失。  >> 最終，如道金斯所言，自然選擇的對象是基因，不管是動物的還是微生物的基因。相應地，羅森伯格的觀點被稱作“全基因體選擇”(hologenome selection)：對宿主基因及微生物區系基因的組合做選擇。 >> 我們的微生物區係爲了自身利益，演化出了抑制免疫系統的能力，這個想法似乎令人有些緊張不安——一個關乎我們生存的重大安全機制，被我們最古老的敵人在最高級別篡改了。但不必擔心，人類與微生物區系共同演化的歷史，已經將我們的免疫系統調整成對雙方最有利的狀態。 >> 法薩諾的發現告訴了我們與免疫系統有關的一點。當腸道內有健康的環境與正常的微生物區系時，蛋白鏈鎖定到位，腸壁細胞緊密地靠在一起，沒有任何大型或危險的物質可以進入血液。然而當微生物區系失去平衡，它會表現得像是被溫和版的霍亂弧菌感染一樣，刺激免疫系統。接着免疫系統會做出回應，釋放出連蛋白，使腸壁細胞間的蛋白鏈鬆開，想辦法將細菌衝出體外。腸壁不再是一面堅不可摧的牆壁，將所有食物分子以外的東西阻隔在外，它的細胞之間出現漏洞，“不法分子”趁機穿過，藉由血液向人體內的其他樂土移動。 >> 我們是時候從“衛生假說”過渡到“老朋友假說”了：我們並非缺乏感染，而是缺乏會訓練並安撫免疫系統的有益微生物。 ◆ 第5章 細菌大戰：抗生素的濫用 >> “食物中的抗生素殘留是造成肥胖症流行的根本原因 >> 正確的洗手方式——用普通不含抗菌成分的肥皂，在溫水下搓洗15秒——是非常重要的，它是維護公共衛生的中流砥柱，並且對降低感染傳播有顯著效果，特別是腸胃疾病的傳播 >> 我們用肥皂和除臭劑來維持身上好聞的味道，卻同時開啓了惡性循環。肥皂和除臭劑除掉了皮膚上的硝化細菌，意味着皮膚上的細菌平衡被破壞了；細菌組成的改變會使汗水的味道變得難聞，所以我們得用肥皂清洗身體，並且用除臭劑蓋掉臭味 >> AOBiome的許多其他員工也不再使用肥皂和除臭劑，而且經常一星期，甚至一年只洗幾次澡。 ◆ 第6章 人如“其”食：微生物喫什麼，你就“變成”什麼 >> 來自胃的消化酶，加上胰腺和小腸本身分泌的酶，將大的食物分子分解成小分子，讓它們能夠穿過腸黏膜的細胞進入血液中。蛋白質就像扭曲且摺疊的珍珠項鍊，被分散成短鏈和一顆顆被稱作“氨基酸”的“珍珠”，它們是建構人體的基礎分子；複雜的碳水化合物被切割成更容易吸收的片狀物，稱作“單糖”，例如葡萄糖和果糖，脂肪則被分解成甘油和脂肪酸。這些小分子被我們的身體吸收，製造能量、形成肌肉並再次爲我們所用。 >> 事實上，微生物區系對人體營養的貢獻遠比製造維生素重要多了。對某些動物來說，若是沒有微生物幫助吸收營養，進食可以說是完全無用的。 >> 纖維攝取量可能在肥胖症的流行中發揮了重要作用，但不代表脂肪和糖分就變得無關緊要。在高脂肪、高糖分的飲食中，複合碳水化合物的含量通常都很低。大部分纖維都是碳水化合物 >> 阿糖基木聚糖是包括小麥和黑麥在內的全穀物中纖維的重要組成部分，在小鼠的高脂肪飲食中補充阿糖基木聚醣，和補充低聚果糖有一樣的健康效益，不只雙歧桿菌增加了，擬桿菌和普雷沃氏菌屬細菌的數量也變成了瘦小鼠腸道內該有的比例。只要讓這些小鼠在攝取高脂肪飲食的同時多喫纖維，就可以解決它們的腸漏問題，讓它們的脂肪細胞數量變多，而不是長得更大，降低膽固醇含量，並且減緩體重上升的速度。 >> GPR43是微生物與免疫系統溝通的橋樑。藉着短鏈脂肪酸這把鑰匙，我們喜愛纖維的微生物打開了免疫細胞的鎖，告訴它們不要攻擊。GPR43不只存在於免疫細胞中，也存在於脂肪細胞中。當它被短鏈脂肪酸打開之後，會強迫脂肪細胞分裂，以健康的方式儲存能量，而不是讓脂肪細胞變得更大。更重要的是，以短鏈脂肪酸解開GPR43會釋放纖瘦素，這是一種讓你產生飽足感的激素。如此一來，食用纖維也可以讓你有飽足感。 >> 卡尼的研究團隊扭轉了大衆對於飲食與體重的因果關係的認知。比起卡路里攝取與消耗的平衡，飲食（特別是纖維）、微生物、短鏈脂肪酸、腸壁滲透性及慢性發炎讓肥胖症看起來更像一種能量調節的疾病，而不單純是暴飲暴食的結果 >> 人如“其”食。更重要的是，你的微生物喫什麼，你就會變成什麼樣。在你喫東西之前，先爲你的微生物想想，它們今天會希望你喫什麼呢？ ◆ 第7章 從第一次呼吸開始：來自母親的微生物 >> 。不管你是否本能上對此感到厭惡，但這對嬰兒來說是一個好的開始。生產之後，母親給孩子的第一套生日套裝，就是陰道中和糞便中的微生物。 >> 所以他在醫護人員離開房間後，用醫療棉棒將妻子的陰道微生物轉移到了女兒身上。 >> 免疫系統不僅將有害的細菌趕出身體，還會將有益菌送往正確的地方，將它們傳遞給新生兒。這是一個偉大的策略：細菌可以得到一個空間大、競爭者少的新家，嬰兒在出生時也可以得到實用的細菌補給。 ◆ 第8章 微生物修復：從益生菌到“糞便移植” >> 關於益生菌，有三點需要注意。第一點是產品中含有哪些菌種和菌株。這些內容物通常不會被詳細描述，或者所寫的和實際培養或測序的菌種內容不符。種類越多有可能越好，但目前我們對不同菌株對身體的影響所知甚少。第二點，產品中含有多少細菌個體，或是多少“菌落形成單位”（colony-forming unit，簡稱CFUs）。這個問題必須回到這些旅客在腸道中所面臨的競爭。菌落形成單位越高，表示產生效應的概率越大。第三點，細菌如何被包裝。益生菌被包裝成各種形式：粉末、藥丸、營養棒、酸奶、飲料 >> 這也意味着它們是最初人類菌羣研究的主要對象。若是在DNA測序和厭氧培育的新世界中選擇益生菌，我們很可能不會選擇乳酸菌來鞏固我們腸道的細菌多樣性 >> 那些對胰島素再次變得敏感的男性，其體內微生物區系的多樣性從178種增加到了234種。這些新增加的細菌屬於會製造短鏈脂肪酸丁酸鹽的種類，而丁酸鹽則被認爲是預防肥胖症的重要力量 >> 要維持長久的效應，我們必須爲有益菌提供一個適合的環境，一個讓它們可以繁榮發展的環境，通過日積月累，直到它們不需外界介入就能自行補充數量。要達到這個目標，我們必須求助於益生元(prebiotics)。這些東西不是活菌，而是細菌的食物，可以增加健康菌株的整體族羣數量。例如低聚果糖、菊粉和低聚半乳糖， >> 不管是單獨食用還是從食物（例如洋蔥、大蒜、韭菜、蘆筍和香蕉）中攝取益生元，它們帶來的好處可能比益生菌還要廣泛。研究發現益生元對於治療食物中毒和溼疹非常有效 >> 基本上，美國人和非美國人的微生物組成的差異，反映了食肉和植食哺乳動物的差異。美國人的腸道微生物專門分解蛋白質、糖分和糖的替代品，委內瑞拉的印第安人和馬拉維人的腸道微生物則適合分解植物中的澱粉。也許，那些考慮原始人飲食法的人要深思一下了。 ◆ 終曲 21世紀的健康 >> 闌尾一度被認爲是人類演化史中一個毫無意義的退化器官，但我們現在知道，它其實是微生物的藏身處，爲人體的免疫系統做培訓 >> 值得注意的是，許多被發現與“21世紀文明病”相關的遺傳基因變異，大都和腸黏膜滲透性及免疫系統調節有關。 >> 我們現在意識到，人類並非因爲上了年紀，心臟就會變硬、細胞就會失去控制地增殖、血管就會爆裂。醫學的新研究指出，這些都不是老化帶來的疾病，而是炎症。如果其中存在高齡的影響， >> 因此，減少抗生素不必要使用的第一步，是發展快速生物指標識別技術，在幾分鐘或幾小時內鑑別易於從人類身上採集的樣本，如糞便、尿液、血液，甚至是呼吸。 >> 創造出可以破壞它們的抗生素，只有針對單一菌種，才能避免對有益微生物區系造成連帶傷害。將事後治療抗生素副作用的支出投入開發此類藥物的額外花費上，也算是降低風險的一種方法。 >> 瞭解並操縱個體的微生物區系以改善藥物造成的結果，是個人化醫療的下一步 >> 蔬菜、豆類和莢果（例如豌豆、黃豆等）往往比水果含有更多的纖維和更少的糖分 >> 如果問我們從“人類基因組計劃”中學到了什麼，那就是基因（先天條件）給了我們基本設定，使我們較容易患上某些疾病；但我們是否真的會得這些病，取決於我們的生活方式、我們的飲食，以及我們的經歷-總之就是會受到後天環境的影響。 >> 但事實上我們知道，我們的DNA很少對我們的日常生活下達指令。而組成其他90%的100萬億個細胞和440萬個微生物基因也是我們的一部分，與我們一同演化，我們不能沒有它們

一本科普書，20萬字，用時11小時讀完。讀國外作者寫的這類書，會有一種感覺，一篇文章能解決的問題，偏要弄成一本書。核心觀點：你只有10%是人類，你不是一個個體，而是一個生態系統，其中的微生物佔比達90%，是身體裏的動物園主宰了你。要杜絕21世紀的文明病，避免現代生活摧毀你的動物園，要關注他們的家園（腸道）、飲食（植物）、生態（抗生素）。 客觀地說，讀完後，對我是有啓發性的。但書中的相關性與因果性有牽強之感，有些數據已經過時，有些說法明顯武斷，作者的不嚴謹和侷限也很明顯，主旨只有一個：重視腸道健康。 1、所有疾病都源於腸道，腸道是人體的微生物的中心，盲腸和闌尾是免疫細胞的住所。腸道微生態失衡是導致21世紀文明病的主因，壓力使情況更嚴重，包括肥胖，過敏、抑鬱。 2、解決腸道失衡首先需要避免濫用抗生素，抗生素的副作用是皮疹和腹瀉，是微生物生態失衡的明顯症狀，抗生素會對家畜有增重影響，人要警惕抗生素導致的肥胖。作者強調包括家用除菌日用品的使用也要謹慎，尤其含三氯生成分的除菌產品，儘量遠離。用普通的肥皂洗手即可，甚至提倡少洗澡，因爲你的皮膚會自己照顧自己，有硝化細菌在內的微生物的幫助。 3、人如其食，你喫什麼，決定你會變成什麼。大腸裏的微生物的主食是植物纖維。在滿足你的口腹之慾時，別忘了用果蔬餵飽你體內的微生物。 4、選擇自然分娩和母乳餵養，母親給孩子的微生物是其健康成長的基石。 總而言之，威脅我們與微生物友誼的有三點：濫用抗生素、飲食缺少纖維，以及生產和養育孩子方式的改變。言而總之，要健康，那就要健康飲食與好好休息。 摘抄： 基因數實際上低於所有科學家的預測，僅有21000個。寄生在人類身體中的微生物共有440萬個基因。 闌尾平均長8厘米、外徑1厘米，外形呈管狀，它不是一個萎縮的肉串，裏面充滿了免疫細胞。 糞便約75%的溼重來自細菌，約17%是植物纖維。腸道內都有大約1.5千克的細菌，差不多跟肝臟一樣重， 被稱爲“血清素”的神經遞質主要存在於我們的腸道內，“色胺酸”會直接轉變成血清素。 甲硝唑抗生素會殺死厭氧細菌（在無氧環境中生存的細菌），由此導致的微生物區系組成的改變，會改變免疫系統的基本反應，並且直接干預人類的基因，使生產黏蛋白的基因產量下降，導致保護性黏液層也隨之變薄。 肥胖症、過敏、自身免疫性疾病與精神疾病都顯示出腸道滲透性增加的跡象，以及接踵而來的慢性發炎。發炎是自身免疫系統過度反應的結果，它會攻擊穿越腸道邊界進入體內的“非法入境”者，從麩質、乳糖等食物分子到脂多糖等細菌的產物，都在攻擊範圍內。 我們都知道抽菸喝酒會增加患癌的風險，但一般人不知道的是，我們更容易因爲超重而患癌。 抗生素是造成肥胖症流行的主要原因。 醫生開的抗生素處方大約有三分之一是給兒童使用的。 正確的洗手方式——用普通不含抗菌成分的肥皂，在溫水下搓洗15秒。 酒精可以摧毀微生物細胞，而且它們沒有抵抗的能力。 硝化細菌是一個特別敏感的細菌族羣，而且繁殖得很慢，所以每天的清潔對它們來說就像受到化學物質轟炸。沒有硝化細菌，我們排出的氨就不會轉化成亞硝酸和一氧化氮，要是沒有了一氧化氮，依靠我們的汗水維生的棒狀桿菌和葡萄球菌就會失控。而棒狀桿菌屬細菌的數量變化，似乎就是我們身上難聞氣味的罪魁禍首。 雙歧桿菌是一種特別喜歡纖維的細菌。低聚果糖作爲高脂肪飲食的補充（香蕉、洋蔥和蘆筍中都含有這種膳食纖維），而它真的讓腸道中的雙歧桿菌數量增加了。 若是喫了高脂食物卻沒有同時喫下高纖食物，對腸黏膜會有不好的影響。每天喫2種水果和5種蔬菜。 母親給孩子的第一套生日套裝，就是陰道中和糞便中的微生物。作爲母親，女性不只傳遞基因，也傳遞數百種細菌的基因。 女性很久以前就有用喝酸奶治療黴菌性陰道炎（一種酵母菌感染）的民間療法。 即使經歷了4次剖宮產，選擇自然分娩也不會有重大的額外風險。剖宮產出生的人患強迫症的概率是一般人的2倍。所以他在醫護人員離開房間後，用醫療棉棒將妻子的陰道微生物轉移到了女兒身上。 成人需要植物的膳食纖維，嬰兒則需要母乳中的低聚糖。 母乳包含的130種低聚糖中，有些專門對付特殊的病原體。很少有配方奶粉中含有低聚糖或活菌。 哺乳會減少女性在晚年患2型糖尿病、高膽固醇、高血壓和心臟病的風險。 到目前爲止，糞便移植顯然是治療腸易激綜合徵最有效的療法。 乳酸菌能在益生菌工業中拔得頭籌的主要原因是易於培養，因爲它們能在氧氣中存活。我們必須求助於益生元。這些東西不是活菌，而是細菌的食物，可以增加健康菌株的整體族羣數量。例如低聚果糖、菊粉和低聚半乳糖。 不管是單獨食用還是從食物（例如洋蔥、大蒜、韭菜、蘆筍和香蕉）中攝取益生元，它們帶來的好處可能比益生菌還要廣泛。研究發現益生元對於治療食物中毒和溼疹非常有效，甚至可能可以預防結腸癌。 人類並非因爲上了年紀，心臟就會變硬、細胞就會失去控制地增殖、血管就會爆裂。醫學的新研究指出，這些都不是老化帶來的疾病，而是炎症。如果其中存在高齡的影響，那就是我們對身體的忽視，因爲我們有足夠的時間放任身體產生炎症，並使其發展到災難性的地步。 抗生素可以幫助你，也會傷害你。衡量抗生素帶來的好處是否大於你需要付出的代價。

全書太囉嗦了，論據和數據沒有明確出處，車軲轆話反覆說來說去，讀的不勝其煩。概括起來也就是: (1)腸道菌羣和微生物很重要，要保持好的飲食習慣，不亂用抗生素。 (2)胃腸道不光是消化器官，也是重要的情緒器官，要保持良好心態。 (3)如果腸道菌羣紊亂了，可以考慮口服益生菌，也可以做糞菌移植。

讀完《人體動物園》，我徹底改變了對人體和微生物的認知，原來我們的身體是一個龐大的微生物共生系統，這些微小生物與我們的健康息息相關。 書中讓我明白，微生物並非都是有害的，它們參與人體消化、免疫等多項生理活動，是維持身體正常運轉的關鍵。而抗生素雖是治病良藥，卻會無差別殺滅有益和有害微生物，濫用會破壞體內菌羣平衡，損害健康。 同時，我也瞭解到纖維素、益生菌和益生元對維持微生態的重要性。纖維素是腸道微生物的養料，益生菌能直接補充有益菌，益生元則爲益生菌提供養分，三者共同守護腸道菌羣穩定。

好書，有很多關於微生物的新知，兼具趣味性與科學性，讀起來也很順暢。 作者提出來兩個假說，一是關於減肥，肥胖的機理我們通常知道的就是卡路里假說，我看過還有一種假說是胰島素假說，比如《我們爲什麼喫（太多）：食慾的新科學》，《肥胖代碼》等書中講到肥胖是因爲胰島素分泌過多，這本書提出第三種假說，微生物假說，特定微生物會導致肥胖，二是關於健康，我們通常認爲人生病是因爲病原體入侵，比如感冒，這是“衛生假說”，因此要用抗生素等殺滅病原體，但這種假說解釋不了越來越多的心血管、中風、糖尿病、癌症等 21 世紀文明病，這本書指出要用“老朋友假說”替代“衛生假說”，所謂老朋友就是我們腸道的益生菌，甚至還包括一些有害菌。 人體並非一個裸猿，而是包含 100 萬億個微生物在內的共生體，這些微生物包含的基因甚至佔到共同體基因總量的 90%。這給我們帶來一個很大的啓示，我們喫的每一口食物，並非只是補充自身所需，還有很大一部分是爲了腸道的的微生物喫的，我們要有意識的挑選益生菌所需要的食物，比如包含膳食纖維的食物。甚至我們還需要挑選與誰在一起，在什麼地方生活，我們無法改變自己的基因，但是我們可以改變微生物的菌落，也就相應改變了我們微生物共同體的基因。 從第一次呼吸到嚥下最後一口氣，我們都有微生物陪伴。隨着身體的成長與變化，我們體內的微生物組也會跟着改變，並且利用它們的快速應變能力來滿足我們和它們自己的需求，爲我們的基因組提供延展性。如果一切順利，母親的微生物會是孩子得到的最棒的生日禮物。也就是說，當我們開始學習走路、講話、照顧自己時，父母的微生物就和我們生活在一起了。作爲成人，照顧包括人類細胞與微生物在內的體內細胞是我們的責任。